Na ovplyvnenie fenotypu hostiteľa a ochorenia musia byť zmeny v zložení mikrobiómu, ktoré boli preukázané u pacientov s primárnou sklerotizujúcou cholangitídou (PSC), sprevádzané funkčnými zmenami.
Vedci sa v článku zamerali na charakterizáciu genetického potenciálu črevného mikrobiómu u pacientov s PSC v porovnaní so zdravými kontrolami (HC) a pacientmi so zápalovým ochorením čriev (IBD).
Metódy: Fekálna DNA z 2 kohort (1 nórska a 1 nemecká), celkovo zahŕňajúcich 136 pacientov s PSC (58 % s IBD), 158 HC a 93 pacientov s IBD bez PSC, bola podrobená metagenomickému sekvenovaniu pomocou brokovnice, čím sa vygenerovalo 17 mld. sekvencie párového konca, ktoré boli spracované pomocou HUMAnN2 a MetaPhlAn2 a analyzované pomocou zovšeobecnených lineárnych modelov a metaanalýz náhodných efektov. Výsledky: Pacienti s PSC mali menej mikrobiálnych génov v porovnaní s HCs (P < 0,0001). V porovnaní s HC vykazovali pacienti s PSC obohatenie a zvýšenú prevalenciu druhov Clostridium a vyčerpanie napríklad Eubacterium spp a Ruminococcus obeum. Pacienti s PSC vykazovali výrazné rozdiely v množstve génov súvisiacich so syntézou vitamínu B6 a syntézou aminokyselín s rozvetveným reťazcom (Qfdr < 0,05). Cielená metabolomika plazmy od nezávislého súboru pacientov s PSC a kontrol zistila znížené koncentrácie vitamínu B6 a aminokyselín s rozvetveným reťazcom v PSC (P < 0,0001), čo je silne spojené so zníženým prežitím bez transplantácie pečene (log-rank P < 0,001). Medzi pacientmi s PSC s a bez IBD sa nezistili žiadne taxonomické alebo funkčné rozdiely.
Závery: Črevný mikrobióm u pacientov s PSC vykazuje veľké funkčné rozdiely v porovnaní s HC, vrátane mikrobiálneho metabolizmu základných živín. Zmeny v súvisiacich cirkulujúcich metabolitoch spojených s priebehom ochorenia, čo naznačuje, že mikrobiálne funkcie môžu byť relevantné pre proces ochorenia v PSC.
(Gastroenterology. 2021 Apr;160(5):1784-1798.e0)
Čo je veda a ako jej porozumieť?
LIcencia publikovaného článku, pravidlá zdieľania a použitia
